Protein–RNA interactions for Protein: P42703

Lifr, Leukemia inhibitory factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LifrP42703 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LifrP42703 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LifrP42703 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LifrP42703 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LifrP42703 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LifrP42703 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LifrP42703 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LifrP42703 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LifrP42703 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LifrP42703 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LifrP42703 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LifrP42703 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LifrP42703 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LifrP42703 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LifrP42703 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LifrP42703 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LifrP42703 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LifrP42703 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LifrP42703 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LifrP42703 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LifrP42703 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LifrP42703 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LifrP42703 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LifrP42703 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LifrP42703 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LifrP42703 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LifrP42703 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LifrP42703 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LifrP42703 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LifrP42703 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LifrP42703 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LifrP42703 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LifrP42703 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LifrP42703 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LifrP42703 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LifrP42703 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LifrP42703 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LifrP42703 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LifrP42703 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LifrP42703 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LifrP42703 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LifrP42703 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LifrP42703 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LifrP42703 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LifrP42703 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LifrP42703 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LifrP42703 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LifrP42703 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LifrP42703 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LifrP42703 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LifrP42703 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LifrP42703 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LifrP42703 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LifrP42703 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LifrP42703 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LifrP42703 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LifrP42703 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LifrP42703 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LifrP42703 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LifrP42703 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LifrP42703 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LifrP42703 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LifrP42703 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LifrP42703 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LifrP42703 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LifrP42703 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LifrP42703 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LifrP42703 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LifrP42703 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LifrP42703 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LifrP42703 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LifrP42703 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LifrP42703 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LifrP42703 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LifrP42703 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LifrP42703 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LifrP42703 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LifrP42703 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LifrP42703 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LifrP42703 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LifrP42703 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LifrP42703 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LifrP42703 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LifrP42703 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LifrP42703 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LifrP42703 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LifrP42703 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LifrP42703 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LifrP42703 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LifrP42703 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LifrP42703 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LifrP42703 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LifrP42703 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LifrP42703 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LifrP42703 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LifrP42703 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LifrP42703 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LifrP42703 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LifrP42703 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LifrP42703 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms