Protein–RNA interactions for Protein: P41971

Elk3, ETS domain-containing protein Elk-3, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk3P41971 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Elk3P41971 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Elk3P41971 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Elk3P41971 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Elk3P41971 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Elk3P41971 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Elk3P41971 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Elk3P41971 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Elk3P41971 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Elk3P41971 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Elk3P41971 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Elk3P41971 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Elk3P41971 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Elk3P41971 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Elk3P41971 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Elk3P41971 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Elk3P41971 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Elk3P41971 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Elk3P41971 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Elk3P41971 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Elk3P41971 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Elk3P41971 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Elk3P41971 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Elk3P41971 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Elk3P41971 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Elk3P41971 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Elk3P41971 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Elk3P41971 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Elk3P41971 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Elk3P41971 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Elk3P41971 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Elk3P41971 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Elk3P41971 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Elk3P41971 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Elk3P41971 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Elk3P41971 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Elk3P41971 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Elk3P41971 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Elk3P41971 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Elk3P41971 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Elk3P41971 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Elk3P41971 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Elk3P41971 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Elk3P41971 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Elk3P41971 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Elk3P41971 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms