Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VhlP40338 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VhlP40338 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VhlP40338 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VhlP40338 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VhlP40338 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VhlP40338 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VhlP40338 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VhlP40338 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VhlP40338 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VhlP40338 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VhlP40338 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VhlP40338 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
VhlP40338 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VhlP40338 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VhlP40338 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VhlP40338 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VhlP40338 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VhlP40338 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VhlP40338 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VhlP40338 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VhlP40338 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VhlP40338 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VhlP40338 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VhlP40338 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VhlP40338 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VhlP40338 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VhlP40338 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VhlP40338 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VhlP40338 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VhlP40338 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VhlP40338 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VhlP40338 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VhlP40338 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VhlP40338 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VhlP40338 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VhlP40338 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VhlP40338 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VhlP40338 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VhlP40338 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VhlP40338 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VhlP40338 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VhlP40338 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VhlP40338 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VhlP40338 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VhlP40338 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VhlP40338 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VhlP40338 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VhlP40338 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VhlP40338 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VhlP40338 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VhlP40338 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VhlP40338 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VhlP40338 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VhlP40338 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VhlP40338 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VhlP40338 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VhlP40338 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VhlP40338 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VhlP40338 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VhlP40338 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VhlP40338 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VhlP40338 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VhlP40338 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VhlP40338 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VhlP40338 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VhlP40338 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VhlP40338 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VhlP40338 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VhlP40338 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VhlP40338 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VhlP40338 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VhlP40338 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VhlP40338 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VhlP40338 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VhlP40338 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VhlP40338 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VhlP40338 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VhlP40338 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VhlP40338 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VhlP40338 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VhlP40338 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VhlP40338 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VhlP40338 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VhlP40338 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VhlP40338 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VhlP40338 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VhlP40338 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VhlP40338 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VhlP40338 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VhlP40338 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VhlP40338 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VhlP40338 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VhlP40338 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VhlP40338 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VhlP40338 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VhlP40338 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VhlP40338 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VhlP40338 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VhlP40338 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms