Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Chd1P40201 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Chd1P40201 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Chd1P40201 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Chd1P40201 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Chd1P40201 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Chd1P40201 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Chd1P40201 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Chd1P40201 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Chd1P40201 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Chd1P40201 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Chd1P40201 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Chd1P40201 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
Chd1P40201 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Chd1P40201 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Chd1P40201 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Chd1P40201 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Chd1P40201 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Chd1P40201 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Chd1P40201 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Chd1P40201 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC31.07■■■□□ 2.57
Chd1P40201 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Chd1P40201 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Chd1P40201 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Chd1P40201 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Chd1P40201 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Chd1P40201 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Chd1P40201 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Chd1P40201 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Chd1P40201 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Chd1P40201 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Chd1P40201 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Chd1P40201 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Chd1P40201 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Chd1P40201 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Chd1P40201 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Chd1P40201 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Chd1P40201 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Chd1P40201 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Chd1P40201 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Chd1P40201 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Chd1P40201 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Chd1P40201 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Chd1P40201 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Chd1P40201 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Chd1P40201 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Chd1P40201 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Chd1P40201 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Chd1P40201 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Chd1P40201 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Chd1P40201 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Chd1P40201 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
Chd1P40201 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Chd1P40201 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Chd1P40201 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Chd1P40201 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Chd1P40201 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Chd1P40201 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Chd1P40201 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Chd1P40201 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Chd1P40201 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Chd1P40201 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Chd1P40201 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Chd1P40201 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Chd1P40201 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
Chd1P40201 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Chd1P40201 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Chd1P40201 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Chd1P40201 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Chd1P40201 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Chd1P40201 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Chd1P40201 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Chd1P40201 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Chd1P40201 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Chd1P40201 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Chd1P40201 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Chd1P40201 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Chd1P40201 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Chd1P40201 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Chd1P40201 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Chd1P40201 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Chd1P40201 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Chd1P40201 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Chd1P40201 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Chd1P40201 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Chd1P40201 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Chd1P40201 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Chd1P40201 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Chd1P40201 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Chd1P40201 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Chd1P40201 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Chd1P40201 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Chd1P40201 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Chd1P40201 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Chd1P40201 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Chd1P40201 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Chd1P40201 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Chd1P40201 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Chd1P40201 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Chd1P40201 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms