Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Col18a1P39061 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Col18a1P39061 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Col18a1P39061 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Col18a1P39061 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Col18a1P39061 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Col18a1P39061 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Col18a1P39061 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Col18a1P39061 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col18a1P39061 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col18a1P39061 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col18a1P39061 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col18a1P39061 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col18a1P39061 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Col18a1P39061 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Col18a1P39061 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col18a1P39061 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col18a1P39061 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Col18a1P39061 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Col18a1P39061 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Col18a1P39061 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Col18a1P39061 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Col18a1P39061 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Col18a1P39061 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Col18a1P39061 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Col18a1P39061 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Col18a1P39061 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Col18a1P39061 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Col18a1P39061 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Col18a1P39061 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Col18a1P39061 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Col18a1P39061 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Col18a1P39061 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Col18a1P39061 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Col18a1P39061 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Col18a1P39061 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Col18a1P39061 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Col18a1P39061 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Col18a1P39061 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Col18a1P39061 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Col18a1P39061 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Col18a1P39061 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Col18a1P39061 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Col18a1P39061 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Col18a1P39061 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Col18a1P39061 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col18a1P39061 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col18a1P39061 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col18a1P39061 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col18a1P39061 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col18a1P39061 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col18a1P39061 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col18a1P39061 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col18a1P39061 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col18a1P39061 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col18a1P39061 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col18a1P39061 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col18a1P39061 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Col18a1P39061 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Col18a1P39061 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Col18a1P39061 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col18a1P39061 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col18a1P39061 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col18a1P39061 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Col18a1P39061 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Col18a1P39061 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Col18a1P39061 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Col18a1P39061 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Col18a1P39061 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Col18a1P39061 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Col18a1P39061 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Col18a1P39061 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col18a1P39061 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col18a1P39061 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col18a1P39061 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col18a1P39061 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col18a1P39061 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col18a1P39061 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col18a1P39061 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col18a1P39061 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Col18a1P39061 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Col18a1P39061 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col18a1P39061 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col18a1P39061 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col18a1P39061 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col18a1P39061 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col18a1P39061 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col18a1P39061 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col18a1P39061 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col18a1P39061 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col18a1P39061 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Col18a1P39061 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Col18a1P39061 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Col18a1P39061 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col18a1P39061 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Col18a1P39061 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Col18a1P39061 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Col18a1P39061 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Col18a1P39061 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Col18a1P39061 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms