Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TtlP38585 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TtlP38585 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TtlP38585 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TtlP38585 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TtlP38585 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TtlP38585 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TtlP38585 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TtlP38585 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TtlP38585 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TtlP38585 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TtlP38585 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TtlP38585 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TtlP38585 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TtlP38585 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TtlP38585 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TtlP38585 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TtlP38585 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TtlP38585 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TtlP38585 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TtlP38585 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TtlP38585 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TtlP38585 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TtlP38585 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TtlP38585 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TtlP38585 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TtlP38585 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TtlP38585 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TtlP38585 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TtlP38585 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TtlP38585 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TtlP38585 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TtlP38585 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TtlP38585 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TtlP38585 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TtlP38585 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TtlP38585 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TtlP38585 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TtlP38585 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TtlP38585 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TtlP38585 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TtlP38585 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TtlP38585 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TtlP38585 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TtlP38585 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TtlP38585 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TtlP38585 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TtlP38585 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TtlP38585 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TtlP38585 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TtlP38585 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TtlP38585 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TtlP38585 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TtlP38585 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TtlP38585 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TtlP38585 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TtlP38585 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TtlP38585 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TtlP38585 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TtlP38585 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TtlP38585 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TtlP38585 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TtlP38585 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TtlP38585 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TtlP38585 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TtlP38585 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TtlP38585 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TtlP38585 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TtlP38585 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TtlP38585 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TtlP38585 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TtlP38585 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TtlP38585 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TtlP38585 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TtlP38585 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TtlP38585 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TtlP38585 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TtlP38585 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TtlP38585 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TtlP38585 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TtlP38585 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TtlP38585 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TtlP38585 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TtlP38585 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TtlP38585 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TtlP38585 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TtlP38585 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TtlP38585 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TtlP38585 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TtlP38585 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TtlP38585 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TtlP38585 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TtlP38585 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TtlP38585 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TtlP38585 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TtlP38585 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TtlP38585 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TtlP38585 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TtlP38585 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TtlP38585 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms