Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PtprkP35822 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PtprkP35822 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PtprkP35822 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PtprkP35822 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PtprkP35822 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PtprkP35822 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
PtprkP35822 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PtprkP35822 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PtprkP35822 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PtprkP35822 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.77
PtprkP35822 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PtprkP35822 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PtprkP35822 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PtprkP35822 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PtprkP35822 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PtprkP35822 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
PtprkP35822 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
PtprkP35822 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PtprkP35822 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
PtprkP35822 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PtprkP35822 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PtprkP35822 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
PtprkP35822 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PtprkP35822 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
PtprkP35822 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PtprkP35822 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PtprkP35822 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PtprkP35822 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PtprkP35822 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PtprkP35822 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PtprkP35822 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PtprkP35822 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PtprkP35822 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PtprkP35822 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PtprkP35822 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PtprkP35822 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PtprkP35822 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PtprkP35822 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PtprkP35822 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
PtprkP35822 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PtprkP35822 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PtprkP35822 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PtprkP35822 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PtprkP35822 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PtprkP35822 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PtprkP35822 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PtprkP35822 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PtprkP35822 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PtprkP35822 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PtprkP35822 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
PtprkP35822 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
PtprkP35822 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PtprkP35822 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PtprkP35822 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PtprkP35822 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PtprkP35822 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PtprkP35822 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PtprkP35822 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PtprkP35822 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PtprkP35822 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PtprkP35822 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PtprkP35822 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PtprkP35822 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PtprkP35822 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PtprkP35822 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PtprkP35822 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PtprkP35822 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PtprkP35822 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PtprkP35822 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PtprkP35822 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PtprkP35822 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PtprkP35822 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PtprkP35822 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PtprkP35822 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PtprkP35822 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PtprkP35822 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PtprkP35822 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PtprkP35822 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PtprkP35822 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PtprkP35822 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PtprkP35822 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PtprkP35822 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PtprkP35822 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PtprkP35822 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
PtprkP35822 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PtprkP35822 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
PtprkP35822 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PtprkP35822 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PtprkP35822 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PtprkP35822 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PtprkP35822 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PtprkP35822 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PtprkP35822 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PtprkP35822 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PtprkP35822 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PtprkP35822 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PtprkP35822 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PtprkP35822 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PtprkP35822 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms