Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rab20P35295 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rab20P35295 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Rab20P35295 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rab20P35295 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rab20P35295 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rab20P35295 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rab20P35295 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rab20P35295 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rab20P35295 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab20P35295 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab20P35295 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms