Protein–RNA interactions for Protein: P32883

Kras, GTPase KRas, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KrasP32883 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KrasP32883 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KrasP32883 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KrasP32883 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KrasP32883 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KrasP32883 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KrasP32883 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KrasP32883 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KrasP32883 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KrasP32883 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KrasP32883 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KrasP32883 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KrasP32883 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KrasP32883 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KrasP32883 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KrasP32883 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KrasP32883 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KrasP32883 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KrasP32883 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KrasP32883 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KrasP32883 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KrasP32883 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KrasP32883 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KrasP32883 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KrasP32883 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KrasP32883 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KrasP32883 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KrasP32883 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KrasP32883 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KrasP32883 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KrasP32883 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KrasP32883 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KrasP32883 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KrasP32883 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KrasP32883 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KrasP32883 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KrasP32883 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KrasP32883 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KrasP32883 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KrasP32883 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KrasP32883 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KrasP32883 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KrasP32883 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KrasP32883 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KrasP32883 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KrasP32883 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KrasP32883 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KrasP32883 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KrasP32883 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KrasP32883 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KrasP32883 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KrasP32883 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KrasP32883 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KrasP32883 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KrasP32883 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KrasP32883 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KrasP32883 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KrasP32883 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KrasP32883 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KrasP32883 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KrasP32883 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KrasP32883 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KrasP32883 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KrasP32883 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KrasP32883 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KrasP32883 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KrasP32883 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KrasP32883 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KrasP32883 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KrasP32883 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KrasP32883 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KrasP32883 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KrasP32883 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KrasP32883 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KrasP32883 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KrasP32883 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KrasP32883 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KrasP32883 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KrasP32883 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KrasP32883 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KrasP32883 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KrasP32883 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KrasP32883 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KrasP32883 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KrasP32883 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KrasP32883 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KrasP32883 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KrasP32883 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KrasP32883 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KrasP32883 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KrasP32883 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KrasP32883 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KrasP32883 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KrasP32883 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KrasP32883 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KrasP32883 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KrasP32883 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KrasP32883 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KrasP32883 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KrasP32883 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms