Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc11P31313 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc11P31313 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms