Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnnd1P30999 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms