Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk4P30285 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cdk4P30285 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdk4P30285 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms