Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vcam1P29533 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vcam1P29533 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms