Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pabpc1P29341 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pabpc1P29341 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pabpc1P29341 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms