Protein–RNA interactions for Protein: P28654

Dcn, Decorin, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DcnP28654 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DcnP28654 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DcnP28654 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DcnP28654 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DcnP28654 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DcnP28654 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DcnP28654 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DcnP28654 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DcnP28654 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DcnP28654 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DcnP28654 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DcnP28654 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DcnP28654 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DcnP28654 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DcnP28654 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DcnP28654 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
DcnP28654 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DcnP28654 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DcnP28654 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DcnP28654 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DcnP28654 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DcnP28654 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DcnP28654 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DcnP28654 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DcnP28654 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DcnP28654 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DcnP28654 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DcnP28654 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DcnP28654 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DcnP28654 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DcnP28654 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DcnP28654 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DcnP28654 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DcnP28654 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DcnP28654 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DcnP28654 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DcnP28654 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DcnP28654 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DcnP28654 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DcnP28654 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DcnP28654 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DcnP28654 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DcnP28654 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DcnP28654 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DcnP28654 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DcnP28654 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DcnP28654 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DcnP28654 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DcnP28654 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DcnP28654 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DcnP28654 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DcnP28654 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DcnP28654 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DcnP28654 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DcnP28654 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DcnP28654 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DcnP28654 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DcnP28654 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DcnP28654 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DcnP28654 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DcnP28654 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DcnP28654 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DcnP28654 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DcnP28654 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
DcnP28654 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
DcnP28654 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DcnP28654 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DcnP28654 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DcnP28654 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DcnP28654 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DcnP28654 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DcnP28654 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DcnP28654 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DcnP28654 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DcnP28654 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DcnP28654 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DcnP28654 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DcnP28654 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DcnP28654 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DcnP28654 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DcnP28654 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DcnP28654 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DcnP28654 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DcnP28654 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DcnP28654 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DcnP28654 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DcnP28654 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DcnP28654 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DcnP28654 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DcnP28654 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DcnP28654 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DcnP28654 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DcnP28654 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DcnP28654 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DcnP28654 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DcnP28654 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DcnP28654 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DcnP28654 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DcnP28654 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DcnP28654 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms