Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CebpbP28033 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CebpbP28033 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CebpbP28033 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CebpbP28033 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CebpbP28033 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CebpbP28033 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CebpbP28033 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CebpbP28033 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CebpbP28033 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CebpbP28033 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CebpbP28033 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CebpbP28033 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CebpbP28033 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CebpbP28033 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CebpbP28033 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CebpbP28033 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CebpbP28033 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CebpbP28033 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CebpbP28033 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CebpbP28033 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CebpbP28033 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CebpbP28033 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CebpbP28033 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CebpbP28033 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CebpbP28033 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CebpbP28033 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CebpbP28033 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CebpbP28033 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CebpbP28033 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CebpbP28033 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CebpbP28033 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CebpbP28033 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CebpbP28033 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CebpbP28033 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CebpbP28033 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CebpbP28033 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CebpbP28033 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CebpbP28033 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CebpbP28033 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CebpbP28033 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CebpbP28033 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CebpbP28033 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CebpbP28033 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CebpbP28033 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CebpbP28033 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CebpbP28033 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CebpbP28033 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms