Protein–RNA interactions for Protein: P27784

Ccl6, C-C motif chemokine 6, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl6P27784 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl6P27784 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl6P27784 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms