Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rpl3P27659 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rpl3P27659 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpl3P27659 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpl3P27659 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpl3P27659 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpl3P27659 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpl3P27659 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpl3P27659 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpl3P27659 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpl3P27659 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpl3P27659 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpl3P27659 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpl3P27659 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpl3P27659 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpl3P27659 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpl3P27659 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpl3P27659 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpl3P27659 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpl3P27659 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpl3P27659 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpl3P27659 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpl3P27659 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms