Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd40lgP27548 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd40lgP27548 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms