Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2af2P26369 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2af2P26369 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2af2P26369 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2af2P26369 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
U2af2P26369 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2af2P26369 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
U2af2P26369 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
U2af2P26369 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2af2P26369 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms