Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ChgaP26339 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ChgaP26339 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ChgaP26339 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ChgaP26339 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ChgaP26339 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ChgaP26339 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ChgaP26339 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ChgaP26339 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ChgaP26339 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ChgaP26339 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ChgaP26339 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ChgaP26339 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ChgaP26339 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ChgaP26339 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ChgaP26339 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ChgaP26339 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ChgaP26339 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ChgaP26339 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ChgaP26339 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ChgaP26339 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ChgaP26339 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ChgaP26339 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ChgaP26339 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ChgaP26339 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ChgaP26339 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ChgaP26339 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ChgaP26339 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ChgaP26339 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ChgaP26339 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ChgaP26339 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ChgaP26339 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ChgaP26339 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ChgaP26339 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ChgaP26339 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ChgaP26339 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ChgaP26339 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ChgaP26339 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ChgaP26339 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ChgaP26339 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ChgaP26339 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ChgaP26339 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ChgaP26339 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ChgaP26339 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ChgaP26339 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ChgaP26339 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ChgaP26339 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ChgaP26339 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ChgaP26339 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ChgaP26339 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ChgaP26339 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ChgaP26339 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ChgaP26339 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ChgaP26339 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ChgaP26339 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ChgaP26339 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ChgaP26339 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ChgaP26339 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ChgaP26339 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ChgaP26339 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ChgaP26339 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ChgaP26339 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ChgaP26339 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ChgaP26339 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ChgaP26339 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ChgaP26339 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ChgaP26339 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ChgaP26339 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ChgaP26339 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ChgaP26339 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ChgaP26339 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ChgaP26339 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ChgaP26339 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ChgaP26339 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ChgaP26339 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ChgaP26339 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ChgaP26339 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ChgaP26339 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ChgaP26339 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ChgaP26339 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ChgaP26339 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ChgaP26339 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ChgaP26339 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ChgaP26339 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ChgaP26339 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ChgaP26339 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ChgaP26339 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ChgaP26339 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ChgaP26339 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ChgaP26339 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ChgaP26339 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ChgaP26339 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ChgaP26339 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ChgaP26339 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ChgaP26339 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ChgaP26339 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ChgaP26339 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ChgaP26339 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ChgaP26339 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ChgaP26339 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms