Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RdxP26043 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RdxP26043 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RdxP26043 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RdxP26043 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RdxP26043 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RdxP26043 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RdxP26043 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RdxP26043 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RdxP26043 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RdxP26043 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RdxP26043 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RdxP26043 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RdxP26043 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RdxP26043 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RdxP26043 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RdxP26043 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RdxP26043 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RdxP26043 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RdxP26043 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RdxP26043 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RdxP26043 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RdxP26043 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RdxP26043 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RdxP26043 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RdxP26043 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RdxP26043 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RdxP26043 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RdxP26043 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RdxP26043 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RdxP26043 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RdxP26043 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RdxP26043 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RdxP26043 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RdxP26043 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RdxP26043 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RdxP26043 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RdxP26043 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RdxP26043 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RdxP26043 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RdxP26043 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RdxP26043 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RdxP26043 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RdxP26043 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RdxP26043 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RdxP26043 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RdxP26043 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RdxP26043 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RdxP26043 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RdxP26043 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RdxP26043 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RdxP26043 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RdxP26043 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RdxP26043 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RdxP26043 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RdxP26043 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RdxP26043 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RdxP26043 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RdxP26043 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RdxP26043 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RdxP26043 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RdxP26043 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RdxP26043 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RdxP26043 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RdxP26043 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RdxP26043 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RdxP26043 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RdxP26043 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RdxP26043 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RdxP26043 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RdxP26043 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RdxP26043 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RdxP26043 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RdxP26043 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RdxP26043 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RdxP26043 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RdxP26043 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RdxP26043 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RdxP26043 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RdxP26043 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RdxP26043 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RdxP26043 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RdxP26043 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RdxP26043 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RdxP26043 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RdxP26043 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RdxP26043 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RdxP26043 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RdxP26043 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RdxP26043 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RdxP26043 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RdxP26043 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RdxP26043 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RdxP26043 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RdxP26043 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RdxP26043 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RdxP26043 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RdxP26043 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RdxP26043 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RdxP26043 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms