Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou2f1P25425 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou2f1P25425 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms