Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccnd1P25322 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccnd1P25322 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccnd1P25322 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccnd1P25322 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccnd1P25322 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccnd1P25322 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccnd1P25322 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccnd1P25322 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccnd1P25322 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccnd1P25322 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccnd1P25322 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccnd1P25322 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccnd1P25322 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccnd1P25322 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccnd1P25322 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccnd1P25322 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccnd1P25322 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccnd1P25322 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccnd1P25322 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccnd1P25322 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccnd1P25322 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccnd1P25322 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccnd1P25322 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccnd1P25322 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccnd1P25322 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccnd1P25322 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccnd1P25322 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccnd1P25322 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccnd1P25322 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccnd1P25322 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccnd1P25322 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccnd1P25322 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccnd1P25322 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms