Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd247P24161 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd247P24161 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd247P24161 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd247P24161 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd247P24161 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd247P24161 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd247P24161 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd247P24161 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd247P24161 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd247P24161 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd247P24161 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd247P24161 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd247P24161 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd247P24161 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd247P24161 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd247P24161 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd247P24161 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd247P24161 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd247P24161 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd247P24161 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd247P24161 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd247P24161 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd247P24161 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd247P24161 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd247P24161 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd247P24161 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd247P24161 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd247P24161 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd247P24161 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd247P24161 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd247P24161 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd247P24161 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd247P24161 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms