Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 BB019430-202ENSMUST00000218015 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 Gm39375-201ENSMUST00000217068 1039 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Hoxd11P23813 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 4930442G15Rik-201ENSMUST00000213112 1000 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 AC173482.2-201ENSMUST00000224044 750 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 AC154245.1-201ENSMUST00000224615 601 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 Acrbp-201ENSMUST00000032481 584 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hoxd11P23813 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Cgrrf1-203ENSMUST00000133989 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxd11P23813 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms