Protein–RNA interactions for Protein: P23772

Gata3, Trans-acting T-cell-specific transcription factor GATA-3, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata3P23772 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata3P23772 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gata3P23772 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gata3P23772 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gata3P23772 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata3P23772 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata3P23772 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gata3P23772 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms