Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfyaP23708 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfyaP23708 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfyaP23708 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfyaP23708 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfyaP23708 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NfyaP23708 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfyaP23708 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfyaP23708 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms