Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms