Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou5f1P20263 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Pou5f1P20263 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pou5f1P20263 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms