Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ifrd1P19182 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ifrd1P19182 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ifrd1P19182 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ifrd1P19182 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ifrd1P19182 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ifrd1P19182 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ifrd1P19182 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ifrd1P19182 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ifrd1P19182 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ifrd1P19182 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ifrd1P19182 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ifrd1P19182 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ifrd1P19182 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ifrd1P19182 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ifrd1P19182 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ifrd1P19182 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ifrd1P19182 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ifrd1P19182 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ifrd1P19182 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ifrd1P19182 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ifrd1P19182 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ifrd1P19182 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ifrd1P19182 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ifrd1P19182 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ifrd1P19182 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ifrd1P19182 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ifrd1P19182 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ifrd1P19182 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ifrd1P19182 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ifrd1P19182 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ifrd1P19182 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms