Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnc1P19123 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnc1P19123 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnc1P19123 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnc1P19123 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnc1P19123 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnc1P19123 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnnc1P19123 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnc1P19123 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnc1P19123 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnc1P19123 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnc1P19123 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnc1P19123 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnc1P19123 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tnnc1P19123 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tnnc1P19123 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tnnc1P19123 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tnnc1P19123 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnc1P19123 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnnc1P19123 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms