Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RargP18911 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RargP18911 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RargP18911 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RargP18911 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RargP18911 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RargP18911 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RargP18911 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RargP18911 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RargP18911 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RargP18911 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RargP18911 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RargP18911 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RargP18911 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RargP18911 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RargP18911 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RargP18911 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RargP18911 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RargP18911 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RargP18911 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RargP18911 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RargP18911 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RargP18911 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RargP18911 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RargP18911 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RargP18911 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RargP18911 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RargP18911 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RargP18911 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RargP18911 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RargP18911 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RargP18911 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RargP18911 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RargP18911 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RargP18911 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RargP18911 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RargP18911 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RargP18911 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RargP18911 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RargP18911 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RargP18911 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RargP18911 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RargP18911 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RargP18911 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RargP18911 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RargP18911 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RargP18911 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RargP18911 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RargP18911 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RargP18911 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RargP18911 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RargP18911 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RargP18911 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RargP18911 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RargP18911 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RargP18911 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RargP18911 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RargP18911 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RargP18911 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RargP18911 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RargP18911 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RargP18911 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RargP18911 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RargP18911 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RargP18911 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RargP18911 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RargP18911 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RargP18911 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RargP18911 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RargP18911 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RargP18911 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RargP18911 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RargP18911 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RargP18911 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RargP18911 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RargP18911 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RargP18911 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RargP18911 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RargP18911 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RargP18911 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RargP18911 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RargP18911 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RargP18911 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RargP18911 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RargP18911 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RargP18911 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RargP18911 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RargP18911 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RargP18911 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RargP18911 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RargP18911 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RargP18911 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RargP18911 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RargP18911 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RargP18911 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RargP18911 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RargP18911 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RargP18911 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RargP18911 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RargP18911 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms