Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps6ka3P18654 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps6ka3P18654 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps6ka3P18654 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps6ka3P18654 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps6ka3P18654 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps6ka3P18654 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps6ka3P18654 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps6ka3P18654 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rps6ka3P18654 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps6ka3P18654 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps6ka3P18654 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps6ka3P18654 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps6ka3P18654 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps6ka3P18654 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps6ka3P18654 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rps6ka3P18654 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps6ka3P18654 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps6ka3P18654 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps6ka3P18654 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps6ka3P18654 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps6ka3P18654 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps6ka3P18654 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps6ka3P18654 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps6ka3P18654 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps6ka3P18654 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps6ka3P18654 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps6ka3P18654 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps6ka3P18654 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rps6ka3P18654 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rps6ka3P18654 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rps6ka3P18654 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Rps6ka3P18654 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms