Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa-rs1P17533 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa-rs1P17533 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms