Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sptan1P16546 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sptan1P16546 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms