Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabra6P16305 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabra6P16305 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabra6P16305 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabra6P16305 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabra6P16305 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabra6P16305 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabra6P16305 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabra6P16305 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabra6P16305 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabra6P16305 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gabra6P16305 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabra6P16305 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabra6P16305 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabra6P16305 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabra6P16305 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabra6P16305 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabra6P16305 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabra6P16305 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabra6P16305 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gabra6P16305 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabra6P16305 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabra6P16305 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabra6P16305 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabra6P16305 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabra6P16305 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabra6P16305 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabra6P16305 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabra6P16305 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabra6P16305 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabra6P16305 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabra6P16305 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gabra6P16305 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabra6P16305 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms