Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim30aP15533 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim30aP15533 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim30aP15533 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim30aP15533 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim30aP15533 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim30aP15533 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim30aP15533 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim30aP15533 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim30aP15533 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim30aP15533 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim30aP15533 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim30aP15533 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim30aP15533 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim30aP15533 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim30aP15533 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim30aP15533 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim30aP15533 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim30aP15533 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim30aP15533 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim30aP15533 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim30aP15533 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim30aP15533 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim30aP15533 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim30aP15533 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim30aP15533 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim30aP15533 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim30aP15533 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim30aP15533 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim30aP15533 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim30aP15533 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim30aP15533 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim30aP15533 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim30aP15533 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim30aP15533 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim30aP15533 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim30aP15533 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim30aP15533 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim30aP15533 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim30aP15533 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim30aP15533 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim30aP15533 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim30aP15533 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim30aP15533 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim30aP15533 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim30aP15533 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim30aP15533 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim30aP15533 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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