Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Srp54P14576 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Srp54P14576 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Srp54P14576 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Srp54P14576 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Srp54P14576 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Srp54P14576 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Srp54P14576 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Srp54P14576 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Srp54P14576 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Srp54P14576 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Srp54P14576 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Srp54P14576 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Srp54P14576 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Srp54P14576 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Srp54P14576 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Srp54P14576 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Srp54P14576 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Srp54P14576 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Srp54P14576 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Srp54P14576 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Srp54P14576 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Srp54P14576 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Srp54P14576 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Srp54P14576 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Srp54P14576 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Srp54P14576 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Srp54P14576 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srp54P14576 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srp54P14576 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srp54P14576 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srp54P14576 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srp54P14576 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srp54P14576 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srp54P14576 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srp54P14576 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srp54P14576 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srp54P14576 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srp54P14576 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srp54P14576 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Srp54P14576 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Srp54P14576 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Srp54P14576 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Srp54P14576 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Srp54P14576 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Srp54P14576 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms