Protein–RNA interactions for Protein: P14427

H2-D1, H-2 class I histocompatibility antigen, D-P alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-D1P14427 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-D1P14427 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-D1P14427 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-D1P14427 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-D1P14427 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-D1P14427 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-D1P14427 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-D1P14427 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-D1P14427 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms