Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Itga5P11688 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga5P11688 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga5P11688 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga5P11688 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga5P11688 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itga5P11688 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga5P11688 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga5P11688 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms