Protein–RNA interactions for Protein: P11440

Cdk1, Cyclin-dependent kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk1P11440 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdk1P11440 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cdk1P11440 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cdk1P11440 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk1P11440 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk1P11440 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk1P11440 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk1P11440 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk1P11440 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk1P11440 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk1P11440 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk1P11440 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk1P11440 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk1P11440 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk1P11440 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk1P11440 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk1P11440 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk1P11440 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdk1P11440 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdk1P11440 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdk1P11440 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdk1P11440 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdk1P11440 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdk1P11440 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdk1P11440 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdk1P11440 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdk1P11440 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdk1P11440 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdk1P11440 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdk1P11440 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdk1P11440 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdk1P11440 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms