Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P10404 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P10404 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P10404 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P10404 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
P10404 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
P10404 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P10404 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P10404 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P10404 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P10404 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P10404 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P10404 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P10404 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P10404 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P10404 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P10404 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P10404 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P10404 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P10404 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P10404 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P10404 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P10404 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P10404 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P10404 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P10404 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P10404 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P10404 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P10404 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P10404 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P10404 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P10404 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P10404 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P10404 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P10404 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P10404 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P10404 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P10404 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P10404 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P10404 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P10404 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P10404 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P10404 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P10404 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P10404 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P10404 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P10404 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P10404 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P10404 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P10404 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P10404 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P10404 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P10404 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P10404 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
P10404 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
P10404 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
P10404 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
P10404 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
P10404 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P10404 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
P10404 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
P10404 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P10404 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P10404 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
P10404 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P10404 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P10404 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
P10404 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P10404 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P10404 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P10404 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P10404 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P10404 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P10404 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P10404 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P10404 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P10404 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
P10404 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P10404 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P10404 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P10404 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
P10404 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P10404 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P10404 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P10404 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P10404 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P10404 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P10404 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P10404 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P10404 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P10404 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P10404 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P10404 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P10404 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P10404 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P10404 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P10404 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P10404 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P10404 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P10404 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
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