Protein–RNA interactions for Protein: P10146

Ccl1, C-C motif chemokine 1, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl1P10146 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl1P10146 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl1P10146 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl1P10146 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms