Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Myod1P10085 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Myod1P10085 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Myod1P10085 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Myod1P10085 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Myod1P10085 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myod1P10085 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myod1P10085 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myod1P10085 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myod1P10085 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Myod1P10085 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Myod1P10085 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms