Protein–RNA interactions for Protein: P09803

Cdh1, Cadherin-1, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh1P09803 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdh1P09803 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdh1P09803 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdh1P09803 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdh1P09803 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdh1P09803 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdh1P09803 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdh1P09803 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdh1P09803 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdh1P09803 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdh1P09803 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdh1P09803 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdh1P09803 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdh1P09803 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdh1P09803 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdh1P09803 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdh1P09803 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdh1P09803 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdh1P09803 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdh1P09803 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdh1P09803 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdh1P09803 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdh1P09803 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdh1P09803 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdh1P09803 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdh1P09803 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdh1P09803 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdh1P09803 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdh1P09803 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdh1P09803 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdh1P09803 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdh1P09803 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdh1P09803 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdh1P09803 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdh1P09803 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdh1P09803 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdh1P09803 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdh1P09803 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms