Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxa9P09631 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxa9P09631 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa9P09631 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa9P09631 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa9P09631 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa9P09631 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa9P09631 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa9P09631 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa9P09631 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa9P09631 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa9P09631 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa9P09631 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa9P09631 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa9P09631 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa9P09631 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa9P09631 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa9P09631 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa9P09631 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa9P09631 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms