Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csf1P07141 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csf1P07141 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf1P07141 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf1P07141 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csf1P07141 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csf1P07141 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csf1P07141 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csf1P07141 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csf1P07141 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Csf1P07141 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms