Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06323 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06323 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06323 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06323 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06323 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06323 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06323 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06323 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06323 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06323 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06323 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06323 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06323 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06323 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06323 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06323 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06323 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06323 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06323 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06323 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06323 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06323 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06323 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06323 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06323 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06323 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06323 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06323 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06323 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06323 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06323 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06323 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06323 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06323 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06323 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06323 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06323 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06323 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06323 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06323 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06323 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06323 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06323 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06323 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06323 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06323 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P06323 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06323 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06323 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06323 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06323 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06323 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06323 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06323 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06323 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06323 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06323 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06323 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06323 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06323 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06323 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06323 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06323 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06323 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P06323 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P06323 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P06323 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06323 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06323 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06323 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06323 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06323 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06323 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06323 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06323 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06323 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06323 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06323 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06323 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06323 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06323 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06323 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06323 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06323 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06323 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06323 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06323 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P06323 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06323 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06323 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P06323 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P06323 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06323 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06323 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06323 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06323 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06323 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06323 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P06323 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms