Protein–RNA interactions for Protein: P04219

Putative uncharacterized Ig-region protein, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04219 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P04219 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P04219 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P04219 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P04219 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P04219 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P04219 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P04219 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P04219 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P04219 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P04219 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P04219 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P04219 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P04219 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P04219 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P04219 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P04219 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P04219 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P04219 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P04219 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P04219 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
P04219 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
P04219 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P04219 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P04219 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P04219 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P04219 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P04219 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P04219 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P04219 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P04219 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P04219 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P04219 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P04219 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P04219 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P04219 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P04219 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04219 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04219 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04219 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P04219 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04219 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04219 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04219 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04219 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04219 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04219 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04219 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04219 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04219 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04219 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P04219 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04219 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04219 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P04219 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04219 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04219 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04219 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04219 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04219 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04219 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04219 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04219 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P04219 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04219 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04219 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04219 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04219 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04219 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04219 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04219 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P04219 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04219 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04219 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04219 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04219 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04219 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04219 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P04219 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P04219 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04219 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04219 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04219 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04219 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04219 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P04219 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04219 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04219 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04219 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04219 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04219 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04219 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P04219 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04219 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04219 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04219 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04219 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04219 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04219 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04219 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms