Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04212 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04212 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04212 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04212 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04212 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04212 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04212 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04212 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04212 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04212 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04212 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04212 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04212 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04212 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04212 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04212 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04212 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04212 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04212 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04212 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04212 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04212 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P04212 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P04212 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P04212 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04212 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04212 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04212 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04212 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04212 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04212 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04212 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04212 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04212 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04212 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04212 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04212 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04212 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04212 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P04212 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04212 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04212 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04212 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04212 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04212 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04212 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04212 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04212 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04212 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04212 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04212 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04212 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P04212 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04212 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P04212 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04212 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04212 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04212 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04212 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04212 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04212 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04212 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04212 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04212 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04212 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04212 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04212 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04212 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04212 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04212 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04212 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04212 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04212 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04212 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04212 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P04212 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04212 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04212 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04212 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04212 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04212 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04212 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P04212 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04212 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04212 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04212 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04212 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04212 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04212 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04212 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04212 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04212 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04212 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04212 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04212 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04212 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04212 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04212 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04212 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms